Kurzgesagt: BLAST Cli
Sind Bioinformatik Programme nicht herrlich?
Seit über 6 Stunden sind meine 8 Cores voll ausgelastet und in meinem Arbeitsspeicher sind permanent 8-11GB… Zeug. Zwar können das auch viele andere Programme, aber wo sonst wenn nicht bei BLAST hat man nach 6 Stunden auch weiterhin keinen blassen Schimmer ob es noch weitere 6 Stunden dauern wird, evtl nur noch 6 Minuten oder noch 6 Tage-Wochen.
Wenn ich meine Suche im MultiFasta Format eingebe, wäre doch zumindest eine optionale Angabe wie “bin fertig mit Contig 300 von 10000″ drin, da er die meines Wissens sowieso seperat abarbeitet.
Paul Rupek ● 23:49:15 22.05.2010 ● Alles anzeigen ● Abgelegt in: Bioinformatik, Kurz